Saat bermain untuk tim junior Lierse pada 2004-2006, ia mampu mencetak 121 gol dari 68 pertandingan. Setelah Lierse terdegradasi dari Liga Pro Belgia, Anderlecht memboyong Lukaku pada musim panas 2006. Di tim junior Anderlecht, pemain kelahiran 13 Mei 1993 itu mengemas 131 gol dari 93 laga.
Ketika Lukaku berusia 16 pada 13 Mei 2009, ia menandatangani kontrak profesional bersama Anderlecht. Sebelas hari kemudian, ia mengukir debutnya bersama tim utama di laga playoff melawan Standard Liege pada menit ke-69.
Sejak musim 2009/2010, pria yang belum menjalani tes medis di MU itu pun dijadikan sebagai pemain inti mereka. Lukaku membayar kepercayaan itu dengan koleksi 19 gol dan 11 assist dari 45 laga di semua kompetisi. Kontribusinya membawa Anderlecht juara Liga Pro Belgia musim itu. Musim selanjutnya, koleksinya bertambah menjadi 20 gol.